| क्र.सं. | आयुक्त का नाम | पदभार संभालने की तिथि | कार्यमुक्ति की तिथि |
| 1 | श्री दलवीर सिंह | 16.06.1993 | 31.01.1994 |
| 2 | श्री वी. लालवुला | 31.01.1994 | 30.11.1994 |
| 3 | श्री लालुंगहेमा | 01.12.1994 | 30.11.1997 |
| 4 | श्री ज़ेद. तोछावंग | 30.11.1997 | 13.06.1999 |
| 5 | श्री के.के. दास | 14.06.1999 | 01.05.2001 |
| 6 | श्री ज़ेद. तोछावंग | 01.06.2001 | 24.08.2001 |
| 7 | श्री डी.डी. इंग्ति | 25.08.2001 | 13.06.2005 |
| 8 | श्रीमती सी.जी.लाल | 17.06.2005 | 27.01.2006 |
| 9 | श्री आर.डी. नेगी | 02.02.2006 | 19.06.2008 |
| 10 | मिस ईवा एम. आर. हाइन्निवता | 20.06.2008 | 13.08.2008 |
| 11 | मिस संध्या बालिगा | 14.08.2008 | 19.05.2009 |
| 12 | श्री एस. आर. बरूवा | 19.05.2009 | 16.05.2011 |
| 13 | श्री बी. थामर | 16.06.2011 | 08.06.2012 |
| 14 | श्री गाईगोंग्दिन पानमै | 27.06.2012 | 13.09.2015 |
| 15 | वंदना देवरी | 14.09.2015 | 25.10.2018 |
| 16 | श्री के.अशी खेया | 25.10.2018 | अब तक |
सीमा शुल्क की आयुक्तालय (निवारक)
पूर्वोत्तर क्षेत्र, शिलांग
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वित्त मंत्रालय (राजस्व विभाग)
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